綠孔雀腸道菌群基因組特征和耐藥性的宏基因組測(cè)序分析

摘要： 為明確綠孔雀腸道菌群耐藥基因及可移動(dòng)元件的分布特征，對(duì)云南野生動(dòng)物園，開放式飼養(yǎng)的健康綠孔雀糞便采樣，提取其DNA后進(jìn)行宏基因組測(cè)序。使用NCBI-nr數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行物種注釋及相對(duì)豐度計(jì)算，得出綠孔雀腸道菌群物種分布特征；通過(guò)功能注釋及聚類分析，得出耐藥基因的類型及分布特征。使用BLAST程序搜尋樣本中的可移動(dòng)耐藥基因，并與不同的地域、宿主和體位的細(xì)菌基因組進(jìn)行對(duì)比，分析其差異及近...