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紅光、藍(lán)光處理下馬鈴薯轉(zhuǎn)錄組特異表達(dá)基因密碼子的偏好性分析

江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào) 頁(yè)數(shù)： 13 2024-07-31
摘要： 以紅光、藍(lán)光處理下的馬鈴薯轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，以白光為對(duì)照，各篩選出1 206條、691條特異表達(dá)基因。通過(guò)CodonW、CUSP對(duì)篩選出的基因編碼序列(CDS)進(jìn)行密碼子使用偏好性分析。結(jié)果表明，在紅光、藍(lán)光處理下，馬鈴薯對(duì)基因密碼子的使用偏好性都較弱，都偏好使用A或T(U)結(jié)尾的密碼子。在2種光質(zhì)處理下，特異表達(dá)基因序列密碼子的GC總量都與同義密碼子在第3位的胞嘧啶和鳥嘌呤含...

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