雙自編碼結(jié)合變分貝葉斯的單細(xì)胞RNA-Seq聚類

摘要： 近年來單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)技術(shù)的快速發(fā)展使得在單個(gè)細(xì)胞水平上研究組織器官的異質(zhì)性成為可能。針對單細(xì)胞RNA測序數(shù)據(jù)中準(zhǔn)確鑒定細(xì)胞類型問題，提出一種新的基于雙自編碼結(jié)合變分貝葉斯高斯混合模型的聚類方法，稱之為sc-VBDAE。首先通過對抗自編碼網(wǎng)絡(luò)的編碼和解碼過程重構(gòu)數(shù)據(jù)，然后使用經(jīng)典自編碼對數(shù)據(jù)進(jìn)行降維，獲得低維且有效的數(shù)據(jù)。最后使用變分貝葉斯高斯混合模型對細(xì)...