橄欖轉(zhuǎn)錄組SSR信息分析及分子標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用
園藝學(xué)報(bào)
頁數(shù): 15 2023-11-25
摘要: 選取不同品種(系)橄欖成熟果進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,結(jié)果獲得296 314條序列,應(yīng)用MISA軟件進(jìn)行SSR位點(diǎn)分析,獲得86084個(gè)SSR位點(diǎn),分布在70686條序列中,SSR在所檢測(cè)序列中出現(xiàn)頻率為23.86%,其中54735條序列含有兩個(gè)及以上的SSR位點(diǎn),占比達(dá)68.4%;橄欖轉(zhuǎn)錄組中SSR序列以復(fù)合型核苷酸、單核苷酸、二核苷酸重復(fù)類型為主,三者占SSR總數(shù)的88.88%;單核...