基于家蠶轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的SSR序列分析
山東農(nóng)業(yè)科學(xué)
頁(yè)數(shù): 7 2022-01-19
摘要: 本研究對(duì)家蠶中腸、脂肪體進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,分析SSR位點(diǎn)的分布規(guī)律和特征。
結(jié)果表明,從17 915個(gè)Unigene中共檢測(cè)到1 339個(gè)SSR位點(diǎn),分布在960個(gè)Unigene中。
SSR位點(diǎn)的基序長(zhǎng)度以1 bp為主,隨著基序長(zhǎng)度的增加,SSR位點(diǎn)數(shù)量逐漸減少,SSR位點(diǎn)間的距離和平均長(zhǎng)度逐漸增加。
家蠶SSR單核苷酸基序類(lèi)型以A/T為主,占總基序數(shù)量的53.10%。