基于單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)的拉克羅斯病毒感染神經(jīng)系統(tǒng)細(xì)胞基因表達(dá)差異分析

摘要： 目的 分析受拉克羅斯病毒（LACV）感染的人腦類器官細(xì)胞不同亞群相關(guān)基因表達(dá)差異，揭示不同亞群之間的轉(zhuǎn)錄組特性。方法 選擇GEO數(shù)據(jù)庫中編號(hào)為GSE131434的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，包含2個(gè)樣本，1個(gè)為模擬感染COs的作為陰性對(duì)照組，1個(gè)為受LACV感染的COs。采用R語言“seurat”包對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾、歸一化、主成分分析、UMAP聚類分析，尋找COs亞群。通過“SingleR...