基于蛇足石杉轉(zhuǎn)錄組的SNP和SSR多態(tài)性分析
黔南民族醫(yī)專學(xué)報(bào)
頁(yè)數(shù)： 5 2018-12-30
摘要： 目的:對(duì)蛇足石杉的單核苷酸多態(tài)性(SNP)及微衛(wèi)星短序列重復(fù)多態(tài)性(SSR)進(jìn)行分析。方法:用HISAT、GATK、MISA等軟件對(duì)蛇足石杉轉(zhuǎn)錄組篩選得到SNP和SSR并設(shè)計(jì)了SSR引物。結(jié)果:共發(fā)現(xiàn)50 388個(gè)SNP位點(diǎn),轉(zhuǎn)換占64. 2%,顛換占35. 8%。共篩選出11 934條SSR,分布在9 358個(gè)unigene中,其中含有兩條以上SSR的unigene有1 78...
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