單細(xì)胞Hi-C數(shù)據(jù)分析及應(yīng)用研究進(jìn)展
生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志
頁(yè)數(shù): 7 2023-10-16
摘要: 染色質(zhì)三維基因組結(jié)構(gòu)在細(xì)胞功能和基因調(diào)控中起著關(guān)鍵作用。單細(xì)胞Hi-C技術(shù)可以在細(xì)胞水平上捕獲基因組結(jié)構(gòu)信息,這為研究不同細(xì)胞類型之間基因組結(jié)構(gòu)的變化提供了機(jī)會(huì)。最近,針對(duì)單細(xì)胞HiC數(shù)據(jù)分析出現(xiàn)了一些很好的計(jì)算分析方法。本文首先對(duì)可用的單細(xì)胞Hi-C數(shù)據(jù)分析方法進(jìn)行綜述,包括單細(xì)胞Hi-C數(shù)據(jù)的預(yù)處理方法、基于單細(xì)胞Hi-C數(shù)據(jù)的多尺度結(jié)構(gòu)識(shí)別方法、基于單細(xì)胞Hi-C數(shù)據(jù)集的...