不同時間序列COVID-19基因表達與基因調(diào)控網(wǎng)絡構(gòu)建

摘要： 目的 探討新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疾病進展相關(guān)的潛在調(diào)控因素。方法 從GEO數(shù)據(jù)庫中獲得COVID-19的24個全血轉(zhuǎn)錄組樣本。使用R包“DSEeq2”識別差異表達的mRNA和LncRNA。利用R包“MaSigPro”和短時間序列表達軟件(STEM)識別mRNA和lncRNA的時間表達模式。共表達分析用于發(fā)現(xiàn)mRNA-LncRNA的共表達模式。利用TRRUST數(shù)據(jù)庫...