菝葜全長轉(zhuǎn)錄組測序及分析
中國現(xiàn)代中藥
頁數(shù): 12 2023-07-13
摘要: 目的:獲得菝葜Smilax china L.全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),深入挖掘其功能基因。方法:采用PacBio Sequel測序平臺,分別提取菝葜根、莖、葉3個(gè)部位的RNA,將樣品等量混合后進(jìn)行全長轉(zhuǎn)錄組測序及分析。結(jié)果:共獲得轉(zhuǎn)錄本122 324個(gè),N50長度為1400 nt,鳥嘌呤和胞嘧啶(GC)占比為45.32%,其中92 878個(gè)(75.93%)轉(zhuǎn)錄本在七大數(shù)據(jù)庫中注釋。非冗余...