廣西莪術(shù)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及生物信息學(xué)分析

摘要： 目的：獲取廣西莪術(shù)的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組信息，了解其轉(zhuǎn)錄組的整體水平，挖掘姜黃素類生物合成通路基因。方法：利用Pacbio Sequel測(cè)序平臺(tái)對(duì)廣西莪術(shù)根、莖、葉、花4個(gè)部位的混合樣品進(jìn)行全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，結(jié)合生物信息學(xué)等方法進(jìn)行功能注釋、代謝通路分析、簡(jiǎn)單序列重復(fù)（SSR）分析。結(jié)果：共獲得原始數(shù)據(jù)14.47 Gb，經(jīng)糾錯(cuò)、過(guò)濾、去冗余得到高質(zhì)量一致性序列151 218條。對(duì)所有轉(zhuǎn)錄本...