藥用植物青葙全長轉(zhuǎn)錄組測序分析

摘要： 目的：構(gòu)建藥用植物青葙全長轉(zhuǎn)錄組，旨在為青葙功能基因組學(xué)研究提供遺傳信息。方法：基于PacBio Sequel平臺對青葙的根、莖、葉、花、果5個部位的混合樣本進(jìn)行高通量測序，對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行校正、篩選、聚類、去冗余、過濾、功能注釋和結(jié)構(gòu)分析，獲得青葙全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。結(jié)果：經(jīng)質(zhì)量控制后獲得高質(zhì)量測序reads數(shù)據(jù)量為13.46 Gb，拼接去冗余后獲得155 300條循環(huán)一致性序列（...