崗梅全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及其三萜皂苷生物合成相關(guān)基因的挖掘
中國(guó)現(xiàn)代中藥
頁數(shù): 14 2023-07-06
摘要: 目的:獲得崗梅全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),為深入挖掘崗梅功能基因奠定基礎(chǔ)。方法:采用基于PacBio Sequel平臺(tái)的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)獲取崗梅的根、莖、葉樣品的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),并利用非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、SwissProt蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)、京都基因與基因組百科全書(KEGG)、真核生物相鄰類的聚簇(KOG)、蛋白家族(Pfam)、基因本體(GO)進(jìn)行注釋,分析并鑒定編碼三...